Vinho e queijo são a quinta essência da harmonização. Se é claro para os vinhos tintos e para, mais recentemente os vinhos brancos, esta harmonização com Moscatel de Setúbal já não é tão clara e consensual.
Muitas são as teorias e as discórdias, mas respeitante os princípios básicos da harmonização, esta será sempre uma harmonização por contraste, assente na capacidade acídula do Moscatel de Setúbal, enquanto elemento “talhante” da gordura do queijo e na da doçura versus o sal contido no queijo. A arriscar o melhor tipo de queijo para harmonizar com Moscatel de Setúbal, seria o mais salgado e curado. Um bom exemplo é o queijo de Azeitão, produzido na mesma região.